Dinding sel bakteri tersusun atas persenyawaan antara polisakarida dan protein

Dinding sel bakteri tersusun atas persenyawaan antara polisarida dan protein. Persenyawan tersebut dikenal dengan. A. Hemiselulosa B. Kitin C. Selulosa D. Pektin E. Peptidoglikan Jawaban: E. Peptidoglikan Dinding sel bakteri tersusun atas peptidoglikan Dinding sel tumbuhan tersusun atas hemiselulosa, selulosa, pektin, lignin dan kitin ===========***=========== Semoga Bermanfaat Jangan Lupa Share, Komentar, dan Berikan Kritik Sarannya Sekian Terima Kasih By: purwomp.com Representasi struktur 3D dari protein mioglobin yang berstruktur α-heliks (diberi warna toska).

Mioglobin adalah protein pertama yang strukturnya berhasil diketahui melalui kristalografi sinar-X. Di bagian kanan-tengah, di antara berbagai lilitan, terdapat sebuah gugus prostetik yang disebut heme (diberi warna abu-abu) dan sebuah molekul oksigen (merah) yang diikatnya.

Protein adalah kelompok biomolekul berukuran besar yang terbentuk dari satu rantai panjang asam amino atau lebih. Poly peptide memiliki banyak fungsi dalam makhluk hidup, di antaranya mempercepat reaksi-reaksi metabolisme, mereplikasi Dna, menanggapi rangsangan, memberi bentuk sel dan tubuh, dan memindahkan molekul dari satu lokasi ke lokasi lain.

Perbedaan utama antara satu protein dan protein lainnya adalah urutan asam amino-asam aminonya, yang ditentukan oleh urutan nukleotida dari gen-gennya, dan biasanya menyebabkan lipatan protein menjadi struktur tiga dimensi khusus yang sesuai dengan fungsinya. Sejumlah asam amino membentuk rantai lurus yang disebut polipeptida.

Suatu poly peptide terdiri dari minimum satu polipeptida panjang.

Polipeptida pendek (dengan kurang dari 20–30 asam amino) biasanya tidak dianggap sebagai protein, tetapi disebut molekul peptida atau oligopeptida. Masing-masing asam amino dalam poly peptide terikat ke asam amino di dekatnya oleh ikatan peptida. Urutan asam amino dalam protein ditentukan oleh urutan gen yang disandi dalam kode genetik. Secara umum, kode genetik menghasilkan 20 asam amino standar, meskipun beberapa organisme memiliki asam amino tambahan.

Tak lama setelah atau bahkan selama sintesis, residu dalam protein sering dimodifikasi secara kimiawi melalui proses modifikasi pascatranslasi yang mengubah sifat fisik dan kimia, lipatan, stabilitas, aktivitas, dan fungsi poly peptide.

Beberapa poly peptide memiliki gugus nonpeptida (bukan asam amino), yang dapat disebut kofaktor dan gugus prostetik. Beberapa protein juga dapat bekerja sama untuk menjalankan fungsi tertentu, dan kelompok seperti ini sering membentuk kompleks poly peptide yang stabil.

Begitu terbentuk, protein hanya ada untuk jangka waktu tertentu lalu didegradasi dan didaur ulang dalam sel melalui proses pergantian protein.

Umur protein diukur berdasarkan waktu paruhnya dan mencakup rentang yang panjang. Protein bisa berumur beberapa menit hingga beberapa tahun dengan umur rata-rata 1–two hari dalam sel mamalia. Protein yang aberrant atau salah lipatan terdegradasi lebih cepat, baik karena ditargetkan untuk dihancurkan atau karena tidak stabil. Bersama dengan biomolekul raksasa lainnya seperti polisakarida dan asam nukleat, protein merupakan bagian esensial dari organisme dan terlibat dalam hampir seluruh proses di dalam sel.

Sebagian protein adalah enzim yang berfungsi sebagai katalis dalam reaksi-reaksi biokimia dan bersifat vital untuk metabolisme. Sebagian poly peptide memiliki fungsi pembentuk atau penguat, misalnya protein aktin dan miosin dalam otot dan protein-protein dalam sitoskeleton. Protein-poly peptide lainnya memiliki peran penting dalam persinyalan sel, respons imun, adhesi sel, dan siklus sel.

Hewan memerlukan protein dalam makanannya untuk memperoleh asam amino esensial yang tidak bisa disintesis di dalam tubuh. Sistem pencernaan memecah protein dari makanan untuk dapat digunakan dalam metabolisme. Protein dapat dimurnikan dari komponen seluler lainnya menggunakan berbagai teknik seperti ultrasentrifugasi, presipitasi, elektroforesis, dan kromatografi.

Rekayasa genetika memungkinkan sejumlah metode untuk memfasilitasi pemurnian ini. Metode yang biasa digunakan untuk mempelajari struktur dan fungsi poly peptide yaitu imunohistokimia, mutagenesis terarah-lokasi, kristalografi sinar-X, resonansi magnetik inti, dan spektrometri massa. Sejarah dan etimologi [sunting - sunting sumber ] Protein dikenali sebagai kelompok biomolekul pada abad kedelapan belas oleh Antoine Fourcroy dan lain-lain, yang dicirikan oleh kemampuannya untuk melakukan koagulasi atau flokulasi di bawah perlakuan dengan panas atau asam.

[1] Contoh yang tercatat pada saat itu adalah albumin dari putih telur, albumin dalam serum darah, fibrin, dan gluten gandum. Protein pertama kali dijelaskan oleh kimiawan Belanda Gerardus Johannes Mulder dan dinamai oleh ahli kimia Swedia Jöns Jacob Berzelius pada tahun 1838. [2] [three] Mulder melakukan analisis unsur terhadap protein umum dan menemukan bahwa hampir semua protein memiliki rumus empiris yang sama, yaitu C 400H 620N 100O 120P 1S 1. [4] Ia sampai pada kesimpulan yang salah bahwa mereka mungkin terdiri dari satu jenis molekul (sangat besar).

Istilah “protein” untuk menggambarkan molekul-molekul ini diajukan oleh rekan Mulder, Berzelius; protein berasal dari kata Yunani πρώτειος ( proteios), yang berarti “primer”, [5] “di depan”, atau “berdiri di depan”, [6] ditambah akhiran -in.

Mulder selanjutnya mengidentifikasi produk degradasi poly peptide seperti asam amino leusin yang ia temukan dengan berat molekul (hampir benar) 131 Da. [iv] Sebelum “protein”, nama lainnya telah digunakan, seperti “albumin” atau “bahan albumin” ( Eiweisskörper, dalam bahasa Jerman).

[seven] Ilmuwan nutrisi awal seperti Carl von Voit dari Jerman percaya bahwa protein adalah nutrisi terpenting untuk menjaga struktur tubuh karena secara umum diyakini bahwa “daging membuat daging.” [viii] Karl Heinrich Ritthausen memperluas bentuk protein yang diketahui dengan mengidentifikasi asam glutamat.

Di Stasiun Percobaan Pertanian Connecticut, tinjauan terperinci tentang protein nabati dikumpulkan oleh Thomas Burr Osborne. Ia bekerja dengan Lafayette Mendel dan menerapkan hukum minimum Liebig dalam memberi makan tikus laboratorium, sehingga adanya asam amino esensial pun diketahui. Pekerjaan ini dilanjutkan dan dikomunikasikan oleh William Cumming Rose.

Pemahaman tentang protein sebagai polipeptida muncul melalui karya Franz Hofmeister dan Hermann Emil Fischer pada tahun 1902. [9] [10] Peran sentral poly peptide sebagai enzim dalam organisme hidup tidak sepenuhnya diapresiasi sampai tahun 1926 ketika James B. Sumner menunjukkan bahwa enzim urease sebenarnya adalah protein. [11] Kesulitan dalam memurnikan poly peptide dalam jumlah besar membuat para ahli biokimia protein awal sangat sulit mempelajarinya.

Oleh karena itu, penelitian awal difokuskan pada protein yang dapat dimurnikan dalam jumlah besar, misalnya dari darah, putih telur, berbagai racun, dan enzim pencernaan/metabolik yang diperoleh dari rumah pemotongan hewan. Pada 1950-an, Armor Hot Dog Co. memurnikan 1 kg ribonuklease A dari pankreas sapi murni dan menyediakannya secara complimentary bagi para ilmuwan; gerakan ini membantu ribonuklease A menjadi target utama studi biokimia selama beberapa dekade berikutnya.

[4] Linus Pauling dianggap sukses dalam memperkirakan struktur sekunder protein biasa berdasarkan ikatan hidrogen, sebuah ide yang pertama kali dikemukakan oleh William Astbury pada tahun 1933. [12] Belakangan, karya Walter Kauzmann tentang denaturasi, [13] [14] yang sebagian didasarkan pada penelitian sebelumnya oleh Kaj Linderstrøm-Lang, [fifteen] memberi pemahaman tentang pelipatan protein dan struktur yang dimediasi oleh interaksi hidrofobik.

Protein pertama yang diurutkan adalah insulin, oleh Frederick Sanger, pada tahun 1949. Sanger dengan tepat menentukan urutan asam amino insulin sehingga secara meyakinkan menunjukkan bahwa poly peptide terdiri dari polimer linier asam amino alih-alih rantai bercabang, koloid, atau siklol. [16] Ia memenangkan Hadiah Nobel untuk pencapaian ini pada tahun 1958.

[17] Struktur poly peptide pertama yang diketahhui adalah hemoglobin dan mioglobin, masing-masing oleh Max Perutz dan Sir John Cowdery Kendrew, pada tahun 1958.

[xviii] [nineteen] Hingga 2017 [update], Bank Information Protein memiliki lebih dari 126.060 struktur protein dengan resolusi atomik. [20] Baru-baru ini, mikroskop krio-elektron terhadap kumpulan makromolekul besar [21] dan prediksi struktur protein komputasional terhadap domain protein kecil [22] adalah dua metode yang mendekati resolusi atomik. Jumlah protein yang disandi dalam genom [sunting - sunting sumber ] Jumlah protein yang disandi dalam genom secara kasar sesuai dengan jumlah gen (walaupun mungkin ada sejumlah besar gen yang menyandi RNA protein, misalnya RNA ribosomal).

Virus biasanya menyandikan beberapa ratus protein, arkea dan bakteri beberapa ratus hingga beberapa ribu, sementara eukariota biasanya menyandikan beberapa ribu hingga puluhan ribu protein (lihat ukuran genom untuk daftar contoh).

Biokimia [sunting - sunting sumber ] Protein merupakan biomolekul yang sangat besar atau makrobiopolimer yang tersusun dari monomer berupa asam amino. Ada 20 asam amino standar yang membentuk asam amino (disebut asam amino proteinogenik); masing-masing terdiri dari sebuah karbon alfa yang berikatan dengan sebuah gugus amino (–NH 2), sebuah gugus karboksil (–COOH), sebuah atom hidrogen (H), dan rantai samping (disebut sebagai “R”).

Gugus “R” inilah yang menjadikan setiap asam amino berbeda dan sifat rantai samping ini akan memengaruhi keseluruhan suatu protein. Hanya prolina yang berbeda dari struktur dasar ini karena mengandung cincin yang tidak biasa pada gugus amina ujung-N, yang memaksa gugus amida CO–NH menjadi konformasi tetap.

[23] Rantai samping asam amino standar, yang dirinci dalam daftar asam amino standar, memiliki beragam struktur dan sifat kimiawi. Struktur tiga dimensi dan reaktivitas kimia suatu protein ditentukan oleh efek gabungan dari semua rantai samping asam amino dalam protein tersebut.

[24] Semua asam amino dalam rantai polipeptida saling terhubung oleh ikatan peptida melalui sintesis dehidrasi. Setelah terhubung dalam rantai protein, asam amino individual disebut residu, sedangkan rangkaian atom dinding sel bakteri tersusun atas persenyawaan antara polisakarida dan protein, nitrogen, dan oksigen yang terkait disebut rantai utama atau tulang punggung protein. [25] Istilah poly peptide, polipeptida, dan peptida dinding sel bakteri tersusun atas persenyawaan antara polisakarida dan protein ambigu dan dapat tumpang tindih artinya.

Protein umumnya digunakan untuk merujuk pada molekul biologis lengkap dalam konformasi yang stabil, sedangkan peptida umumnya merujuk pada oligomer asam amino pendek yang sering kali tidak memiliki struktur tiga dimensi yang stabil.

Namun, batas antara keduanya tidak ditentukan dengan baik dan biasanya berkisar antara xx–30 residu. Polipeptida dapat merujuk pada rantai linier tunggal asam amino, biasanya berapa pun panjangnya, tetapi sering kali menyiratkan tidak memiliki konformasi yang tetap. Interaksi [sunting - sunting sumber ] Poly peptide dapat berinteraksi dengan banyak jenis molekul, termasuk dengan protein lain, dengan lipid, dengan karbohidrat, dan dengan Deoxyribonucleic acid.

[26] [27] [28] [29] Kelimpahan dalam sel [sunting - sunting sumber ] Diperkirakan bahwa bakteri berukuran rata-rata mengandung sekitar dua juta protein per sel (misalnya Escherichia coli dan Staphylococcus aureus).

Bakteri yang lebih kecil, seperti Mycoplasma atau spiroket mengandung lebih sedikit poly peptide, sekitar 50.000 hingga 1 juta. Sel eukariota berukuran lebih besar sehingga mengandung lebih banyak protein. Misalnya, sel khamir Saccharomyces cerevisiae diperkirakan mengandung sekitar 50 juta protein dan sel manusia sekitar 1 hingga three miliar. [30] Konsentrasi salinan poly peptide private berkisar dari beberapa molekul per sel hingga 20 juta per sel.

[31] Tidak semua gen yang menyandi protein diekspresikan di sebagian besar sel dan jumlahnya bergantung pada beberapa hal, seperti jenis sel dan rangsangan eksternal. Misalnya, dari sekitar 20.000 protein yang disandi oleh genom manusia, hanya 6.000 yang terdeteksi dalam sel limfoblastoid.

[32] Sintesis [sunting - sunting sumber ] Biosintesis [sunting - sunting sumber ] Protein dirakit dari sejumlah asam amino menggunakan informasi yang disandi dalam gen. Setiap protein memiliki urutan asam amino uniknya sendiri yang ditentukan oleh urutan nukleotida dari gen yang menyandi poly peptide ini.

Kode genetik adalah satu set berupa tiga nukleotida yang disebut kodon dan setiap kombinasi tiga nukleotida menunjukkan asam amino, misalnya AUG (adenina–urasil–guanina) adalah kode untuk metionin. Karena DNA mengandung empat nukleotida, jumlah total kodon yang mungkin adalah 64; oleh karena itu, terdapat beberapa redundansi dalam kode genetik, dengan beberapa asam amino ditentukan oleh lebih dari satu kodon.

[33] Gen yang disandi dalam DNA pertama-tama ditranskripsikan menjadi pra-RNA duta (mRNA) oleh poly peptide seperti RNA polimerase. Kebanyakan organisme kemudian memproses pra-mRNA (juga dikenal sebagai transkrip primer) menggunakan berbagai bentuk modifikasi pascatranskripsi untuk membentuk mRNA yang matang, yang kemudian digunakan sebagai templat untuk sintesis protein oleh ribosom.

Pada prokariota, mRNA dapat digunakan segera setelah diproduksi atau diikat oleh ribosom setelah menjauh dari nukleoid. Sebaliknya, eukariota membuat mRNA di inti sel dan kemudian mentranslokasikannya melewati membran inti ke dalam sitoplasma, tempat sintesis protein kemudian terjadi.

Tingkat sintesis protein pada prokariota lebih tinggi daripada eukariota dan dapat mencapai hingga xx asam amino per detik. [34] Proses sintesis protein dari cetakan mRNA dikenal sebagai translasi. Selanjutnya, mRNA dimuat ke ribosom dan dibaca tiga nukleotida sekaligus dengan mencocokkan setiap kodon dengan antikodon pasangan basa yang terletak pada molekul RNA transfer (tRNA), yang membawa asam amino yang sesuai dengan kodon yang dikenalinya.

Enzim sintetase tRNA-aminoasil “mengisi” molekul tRNA dengan asam amino yang benar. Polipeptida yang sedang terbentuk sering disebut rantai yang baru lahir.

Protein selalu disintesis dari N-terminus ke C-terminus. [33] Ukuran protein yang disintesis dapat diukur dengan jumlah asam amino yang dikandungnya dan dengan total massa molekulnya, yang biasanya dilaporkan dalam satuan dalton (identik dengan satuan massa atom), atau satuan turunan kilodalton (kDa).

Ukuran rata-rata protein makin meningkat dari arkea, bakteri, dan eukariota (masing-masing 283, 311, 438 residu amino dan 31, 34, 49 kDa) karena lebih banyak domain protein yang menyusun poly peptide dalam organisme yang lebih tinggi. [35] Misalnya protein khamir rata-rata memiliki panjang 466 asam amino dan massa 53 kDa.

Protein terbesar yang diketahui adalah titin, komponen dari sarkomer otot, dengan massa molekul hampir 3.000 kDa dan panjang total hampir 27.000 asam amino. [36] Sintesis kimia [sunting - sunting sumber ] Poly peptide pendek juga dapat disintesis secara kimiawi dengan kelompok metode yang dikenal sebagai sintesis peptida, yang mengandalkan teknik sintesis organik seperti ligasi kimiawi untuk menghasilkan peptida dalam jumlah besar. [37] Sintesis kimia memungkinkan untuk memasukkan asam amino non-alami ke dalam rantai polipeptida, seperti pelekatan probe fluoresens ke rantai samping asam amino.

[38] Metode ini berguna dalam laboratorium biokimia dan biologi sel, meskipun umumnya tidak untuk aplikasi komersial. Sintesis kimiawi tidak efisien untuk polipeptida yang lebih panjang dari sekitar 300 asam amino, dan protein yang disintesis mungkin tidak siap mengambil struktur tersier aslinya. Kebanyakan metode sintesis kimia berlanjut dari C-terminus ke North-terminus, berlawanan dengan reaksi dinding sel bakteri tersusun atas persenyawaan antara polisakarida dan protein.

[39] Struktur [sunting - sunting sumber ] Tiga [ pranala nonaktif permanen ] kemungkinan representasi dari struktur tiga dimensi protein isomerase fosfat triosa.

Kiri: Representasi semua cantlet yang diwarnai oleh jenis cantlet. Tengah: Representasi sederhana yang menggambarkan konformasi tulang punggung, diwarnai oleh struktur sekunder. Kanan: Representasi permukaan yang dapat diakses pelarut yang diwarnai oleh jenis residu (residu asam merah, residu basa biru, residu polar hijau, residu nonpolar putih).

Sebagian besar protein terlipat menjadi struktur tiga dimensi yang unik. Bentuk alami suatu protein yang melipat dikenal dengan istilah konformasi asli. [xl] Meskipun banyak protein dapat melipat tanpa bantuan dam hanya melalui sifat-sifat kimiawi asam amino mereka, sejumlah poly peptide lain memerlukan bantuan protein pendamping untuk melipat menjadi kondisi aslinya.

[41] Ahli biokimia sering merujuk pada empat aspek berbeda dari struktur protein. [42] • Struktur primer, merupakan urutan asam amino yang dihubungkan melalui ikatan peptida (amida). Frederick Sanger merupakan ilmuwan yang berjasa dengan temuan metode penentuan deret asam amino pada poly peptide, dengan penggunaan beberapa enzim protease yang mengiris ikatan antara asam amino tertentu menjadi fragmen peptida yang lebih pendek untuk dipisahkan lebih lanjut dengan bantuan kertas kromatografik.

Urutan asam amino menentukan fungsi protein, pada tahun 1957, Vernon Ingram menemukan bahwa translokasi asam amino akan mengubah fungsi protein, dan lebih lanjut memicu mutasi genetik. • Struktur sekunder, yaitu struktur tiga dimensi lokal dari berbagai rangkaian asam amino yang distabilkan oleh ikatan hidrogen. Contoh yang paling umum yaitu • uliran-alfa ( α-helix), berupa pilinan rantai asam amino-asam amino berbentuk seperti spiral; • lempeng-beta ( β-canvass), berupa lembaran-lembaran lebar yang tersusun dari sejumlah rantai asam amino yang saling terikat melalui ikatan hidrogen atau ikatan tiol (S–H); • lekukan-beta ( β-plough); dan • lekukan-gama ( γ-plough).

[43] • Struktur tersier, merupakan gabungan dari aneka ragam dari struktur sekunder dan menjadi bentuk keseluruhan satu molekul protein. Istilah “struktur tersier” sering digunakan sebagai sinonim dengan istilah lipatan. Struktur tersier inilah yang mengontrol fungsi dasar poly peptide.

Beberapa molekul protein dapat berinteraksi secara fisik tanpa ikatan kovalen membentuk oligomer yang stabil (misalnya dimer, trimer, atau kuartomer) dan membentuk struktur kuartener.

• Struktur kuartener, yaitu struktur yang dibentuk oleh beberapa molekul poly peptide (rantai polipeptida). Dalam konteks ini, biasanya disebut subunit protein, yang berfungsi sebagai protein kompleks tunggal.

Contoh yang terkenal adalah enzim Rubisco dan insulin. • Struktur kuiner, yaitu karakteristik dari permukaan protein yang mengatur interior seluler yang padat. Struktur kuiner bergantung pada interaksi makromolekul yang bersifat sementara, tetapi penting, yang terjadi di dalam sel hidup. Struktur primer protein bisa ditentukan dengan beberapa metode: (1) hidrolisis protein dengan asam kuat dinding sel bakteri tersusun atas persenyawaan antara polisakarida dan protein, 6N HCl), lalu komposisi asam amino ditentukan dengan instrumen penganalisis asam amino(2) analisis urutan dari ujung-Due north dilakukan dengan degradasi Edman, (3) kombinasi dari digesti dengan tripsin dan spektrometri massa, dan (iv) penentuan massa molekuler dengan spektrometri massa.

Struktur sekunder bisa ditentukan dengan spektroskopi dikroisme sirkuler (CD) dan spektroskopi inframerah transformasi Fourier (FTIR). [44] Spektrum CD dari uliran-alfa menunjukkan dua absorbans negatif pada 208 dan 220 nm dan lempeng-beta menunjukkan satu puncak negatif sekitar 210–216 nm.

Estimasi dari komposisi struktur sekunder dari poly peptide bisa dikalkulasi dari spektrum CD. Pada spektrum FTIR, pita amida-I dari uliran-alfa berbeda dibandingkan dengan pita amida-I dari lempeng-beta. Jadi, komposisi struktur sekunder dari poly peptide juga bisa diestimasi dari spektrum inframerah. Protein bukanlah molekul yang sepenuhnya kaku. Selain tingkat struktur ini, protein dapat berubah di antara beberapa struktur terkait saat mereka menjalankan fungsinya.

Dalam konteks penataan ulang fungsional ini, struktur tersier atau kuaterner biasanya disebut sebagai “konformasi”, dan transisi di antara keduanya disebut perubahan konformasi. Perubahan tersebut sering kali disebabkan oleh pengikatan molekul substrat ke situs aktif enzim, atau wilayah fisik poly peptide yang berpartisipasi dalam katalisis kimia.

Dalam larutan, poly peptide juga mengalami variasi struktur melalui getaran termal dan tumbukan dengan molekul lain. [45] Secara informal, protein dapat dibagi menjadi tiga kelas utama yang berkorelasi dengan struktur tersier yang khas: protein globular, protein berserat, dan poly peptide membran.

Hampir semua protein globular dapat larut dan banyak di antaranya adalah enzim. Protein berserat sering kali bersifat struktural, seperti kolagen (komponen utama jaringan ikat) atau keratin (komponen protein rambut dan kuku). Protein membran sering berfungsi sebagai reseptor atau menyediakan saluran untuk molekul polar atau bermuatan untuk melewati membran sel.

[46] Dehidron merupakan kasus khusus dari ikatan hidrogen intramolekul di dalam poly peptide, yang terlindung dengan buruk dari serangan air dan karenanya meningkatkan dehidrasinya sendiri. [47] Domain poly peptide [sunting - sunting sumber ] Struktur poly peptide lainnya yang juga dikenal adalah domain, yaitu segmen poly peptide yang melipat menjadi unit struktural yang berbeda.

Struktur ini terdiri dari 40–350 asam amino. Protein sederhana umumnya hanya memiliki satu domain. Pada protein yang lebih kompleks, ada beberapa domain yang terlibat di dalamnya. Hubungan rantai polipeptida yang berperan di dalamnya akan menimbulkan sebuah fungsi baru berbeda dengan komponen penyusunnya. Bila struktur domain pada struktur kompleks ini berpisah, maka fungsi biologis masing-masing komponen domain penyusunnya tidak hilang. Inilah yang membedakan struktur domain dengan struktur kuartener.

Pada struktur kuartener, setelah struktur kompleksnya berpisah, protein tersebut tidak fungsional. Domain biasanya memiliki fungsi spesifik, seperti aktivitas enzimatik (misalnya kinase) atau berfungsi sebagai modul pengikat (misalnya domain SH3 berikatan dengan urutan kaya prolin dalam protein lain).

Motif urutan [sunting - sunting sumber ] Urutan asam amino pendek dalam protein sering bertindak sebagai situs pengenalan untuk protein lain. [48] Misalnya, domain SH3 biasanya mengikat motif PxxP pendek (yaitu two prolin [P], yang dipisahkan oleh dua asam amino [x] yang tidak ditentukan, meskipun asam amino di sekitarnya dapat menentukan spesifisitas pengikatan yang tepat). Banyak motif semacam itu telah dikumpulkan dalam basis data Motif Linear Eukariotik (ELM).

Fungsi seluler [sunting - sunting sumber ] Protein adalah aktor utama di dalam sel, yang menjalankan tugas yang ditentukan oleh informasi yang disandi dalam gen. [49] Dengan pengecualian jenis RNA tertentu, sebagian besar molekul biologis lainnya adalah elemen yang relatif lembam dan dijadikan tempat poly peptide bekerja.

Protein menyusun setengah dari berat kering sel Escherichia coli, sedangkan makromolekul lain seperti Dna dan RNA masing-masing hanya berkontribusi sebesar iii% dan 20%. [50] Kumpulan poly peptide yang diekspresikan dalam sel atau jenis sel tertentu dikenal sebagai proteoma. Karakteristik utama protein yang juga memungkinkan beragam fungsi mereka adalah kemampuannya untuk mengikat molekul lain secara spesifik dan erat.

Area protein yang bertanggung jawab untuk mengikat molekul lain dikenal sebagai situs pengikatan dan sering kali berupa cekungan atau “kantong” pada permukaan molekul. Kemampuan mengikat ini dimediasi oleh struktur tersier dari protein yang menentukan kantong situs pengikatan, dan oleh sifat kimiawi rantai samping asam amino di sekitarnya.

Pengikatan protein bisa sangat ketat dan spesifik; sebagai contoh, protein penghambat ribonuklease berikatan dengan angiogenin manusia dengan konstanta disosiasi subfemtomolar (<10 −fifteen M) tetapi tidak mengikat sama sekali dengan homolognya pada amfibi, yaitu onkonase (>1 Yard). Perubahan kimiawi yang sangat kecil seperti penambahan satu gugus metil ke pasangan-ikatan terkadang cukup untuk hampir menghilangkan pengikatan; misalnya enzim sintetase aminoasil-tRNA yang spesifik untuk asam amino valin, tidak mengikat rantai samping asam amino isoleusin yang sangat mirip.

[51] Protein dapat mengikat protein lain dan juga mengikat substrat molekul kecil. Ketika poly peptide mengikat secara spesifik dengan salinan lain dari molekul yang sama, mereka dapat mengalami oligomerisasi untuk membentuk fibril; proses ini sering terjadi pada poly peptide struktural yang terdiri dari monomer globular yang berikatan-sendiri untuk membentuk serat yang kaku. Interaksi protein-protein juga mengatur aktivitas enzimatik, mengendalikan perkembangan melalui siklus sel, dan memungkinkan perakitan kompleks protein besar yang melakukan banyak reaksi-terkait-serupa dengan fungsi biologis yang sama.

Poly peptide juga dapat mengikat atau bahkan diintegrasikan ke dalam membran sel. Kemampuan pasangan-ikatan untuk menginduksi perubahan konformasi protein memungkinkan pembangunan jaringan pensinyalan yang sangat kompleks. [52] Karena interaksi di dinding sel bakteri tersusun atas persenyawaan antara polisakarida dan protein protein bersifat reversibel dan sangat bergantung pada ketersediaan pasangan poly peptide untuk membentuk agregat yang mampu melakukan rangkaian fungsi yang berbeda, studi tentang interaksi di antara poly peptide tertentu adalah kunci untuk memahami aspek penting fungsi seluler, dan akhirnya sifat-sifat yang membedakan tipe sel tertentu.

[53] [54] Enzim [sunting - sunting sumber ] Peran protein yang paling terkenal di dalam sel adalah sebagai enzim, yang mengkatalisasi reaksi kimia. Enzim biasanya sangat spesifik dan hanya mempercepat satu atau beberapa reaksi kimia. Enzim melakukan sebagian besar reaksi yang terlibat dalam metabolisme, serta memanipulasi Deoxyribonucleic acid dalam berbagai proses seperti replikasi Dna, perbaikan DNA, dan transkripsi.

Beberapa enzim bekerja pada protein lain untuk menambah atau menghilangkan gugus kimia dalam proses yang dikenal sebagai modifikasi pascatranslasi. Sekitar 4.000 reaksi dikatalisis oleh enzim. [55] Percepatan laju yang diberikan oleh katalisis enzimatis sering kali sangat besar, hingga peningkatan laju 10 17 kali lipat dibandingkan reaksi tanpa katalisis dalam kasus orotat dekarboksilase (78 juta tahun tanpa enzim, 18 milidetik dengan enzim).

[56] Molekul yang terikat dan ditindaklanjuti oleh enzim disebut substrat. Meskipun enzim dapat terdiri dari ratusan asam amino, biasanya hanya sebagian kecil dari residu yang bersentuhan dengan substrat, dan fraksi yang lebih kecil lagi—rata-rata tiga hingga empat residu—yang terlibat langsung dalam katalisis. Expanse enzim yang mengikat substrat dan mengandung residu katalitik dikenal sebagai situs aktif. Protein dirigen adalah anggota kelompok protein yang menentukan stereokimia senyawa yang disintesis oleh enzim lain.

[57] Pensinyalan sel dan pengikatan ligan [sunting - sunting sumber ] Banyak protein terlibat dalam proses pensinyalan sel dan transduksi sinyal. Beberapa protein, seperti insulin, merupakan poly peptide ekstraseluler yang mengirimkan sinyal dari sel tempat mereka disintesis (yaitu sel pankreas) ke sel lain di jaringan yang jauh. Jenis lainnya adalah protein membran yang bertindak sebagai reseptor yang fungsi utamanya adalah mengikat molekul pemberi sinyal dan menginduksi respons biokimia di dalam sel.

Banyak reseptor memiliki situs pengikatan yang terekspos pada permukaan sel dan domain efektor dinding sel bakteri tersusun atas persenyawaan antara polisakarida dan protein dalam sel, yang mungkin memiliki aktivitas enzimatik atau mungkin mengalami perubahan konformasi yang dideteksi oleh protein lain di dalam sel. [58] Antibodi adalah poly peptide yang menjadi komponen dari sistem imun adaptif yang fungsi utamanya adalah mengikat antigen (zat asing di dalam tubuh) dan menargetkannya untuk dimusnahkan.

Antibodi dapat disekresikan ke dalam lingkungan ekstraseluler atau berlabuh di membran sel B khusus yang dinding sel bakteri tersusun atas persenyawaan antara polisakarida dan protein sebagai sel plasma. Ketika enzim dibatasi dalam afinitas pengikatan terhadap substratnya oleh kebutuhannya untuk melakukan reaksi, antibodi tidak memiliki batasan seperti itu. Afinitas pengikatan antibodi ke targetnya sangat tinggi.

[59] Banyak poly peptide transpor ligan mengikat biomolekul dinding sel bakteri tersusun atas persenyawaan antara polisakarida dan protein tertentu dan membawanya ke lokasi lain di tubuh organisme multiseluler.

Poly peptide ini harus memiliki afinitas pengikatan yang tinggi jika ligannya terdapat dalam konsentrasi tinggi, tetapi juga harus melepaskan ligan saat berada pada konsentrasi rendah di jaringan target. Contoh protein pengikat ligan adalah hemoglobin, yang mengangkut oksigen dari paru-paru ke organ dan jaringan lain di semua vertebrata dan memiliki homolog serupa di setiap kerajaan biologis.

[threescore] Lektin adalah protein pengikat gula yang sangat spesifik untuk bagian gula mereka. Lektin biasanya berperan dalam fenomena pengenalan biologis yang melibatkan sel dan protein. [61] Reseptor dan hormon adalah protein pengikat yang sangat spesifik. Protein transmembran juga dapat berfungsi sebagai protein transpor ligan yang mengubah permeabilitas membran sel menjadi molekul dan ion kecil.

Membran sendiri memiliki pusat yang hidrofobik sehingga molekul polar atau bermuatan tidak dapat berdifusi. Protein membran mengandung saluran internal yang memungkinkan molekul tersebut untuk masuk dan keluar sel. Banyak protein saluran ion dikhususkan agar hanya memilih ion tertentu; misalnya, saluran kalium dan natrium sering kali hanya memfasilitasi ion yang spesifik.

[62] Poly peptide struktural [sunting - sunting sumber ] Poly peptide struktural memberikan kekerasan dan kekakuan pada komponen biologis yang cair. Sebagian besar protein struktural merupakan protein berserat; misalnya kolagen dan elastin adalah komponen penting dari jaringan ikat seperti tulang rawan, sementara keratin ditemukan pada struktur keras atau berfilamen seperti rambut, kuku, bulu, tapak, dan beberapa cangkang hewan. [63] Beberapa protein globular juga dapat memiliki fungsi struktural, misalnya aktin dan tubulin yang bersifat globular dan dapat larut sebagai monomer, tetapi berpolimerisasi untuk membentuk serat kaku dan panjang yang membentuk sitoskeleton, yang memungkinkan sel untuk mempertahankan bentuk dan ukurannya.

Protein lain yang berfungsi struktural adalah protein motorik seperti miosin, kinesin, dan dinein, yang mampu menghasilkan gaya mekanis. Protein-poly peptide ini sangat penting untuk motilitas seluler pada organisme bersel tunggal dan sperma pada banyak organisme multisel yang bereproduksi secara seksual.

Mereka juga menghasilkan kekuatan yang digunakan dalam kontraksi otot, [64] serta memainkan peran penting dalam transportasi intraseluler. Metode studi [sunting - sunting sumber ] Aktivitas dan struktur protein dapat diperiksa secara in vitro, in vivo, dan in silico.

Studi in vitro tentang poly peptide yang dimurnikan dalam lingkungan terkontrol berguna untuk mempelajari bagaimana protein menjalankan fungsinya. Misalnya, studi kinetika enzim mengeksplorasi mekanisme kimiawi dari aktivitas katalitik enzim dan afinitas relatifnya terhadap berbagai kemungkinan molekul substrat. Sebaliknya, percobaan in vivo dapat memberikan informasi tentang peran fisiologis poly peptide dalam konteks sel atau bahkan organisme secara keseluruhan.

Studi in silico menggunakan metode komputasi untuk mempelajari protein. Pemurnian protein [sunting - sunting sumber ] Untuk melakukan analisis in vitro, poly peptide harus dimurnikan dari komponen seluler lainnya. Proses ini biasanya dimulai dengan lisis sel, ketika membran sel terganggu dan isi internalnya dilepaskan ke dalam larutan yang dikenal sebagai lisat mentah.

Campuran yang dihasilkan dapat dimurnikan menggunakan ultrasentrifugasi, yang memfraksinasi berbagai komponen seluler menjadi fraksi yang mengandung poly peptide yang dapat larut; membran lipid dan protein; organel seluler, dan asam nukleat. Pengendapan dengan metode yang dikenal sebagai pengendapan terinduksi-garam dapat memusatkan protein dari lisat ini.

Berbagai jenis kromatografi kemudian digunakan untuk mengisolasi protein yang diinginkan berdasarkan sifat-sifat seperti berat molekul, muatan bersih, dan afinitas pengikatan. [65] Tingkat pemurnian dapat dipantau dengan menggunakan berbagai jenis elektroforesis gel jika berat molekul dan titik isoelektrik poly peptide yang diinginkan diketahui, dengan spektroskopi jika protein memiliki fitur spektroskopi yang dapat dibedakan, atau dengan uji enzim jika poly peptide memiliki aktivitas enzimatik.

Selain itu, protein dapat diisolasi sesuai dengan muatannya menggunakan pemfokusan listrik. [66] Untuk protein alamiah, serangkaian langkah pemurnian mungkin diperlukan untuk mendapatkan poly peptide yang cukup murni untuk aplikasi laboratorium.

Untuk menyederhanakan proses ini, rekayasa genetika sering digunakan untuk menambahkan sifat kimiawi pada protein yang membuatnya lebih mudah untuk dimurnikan tanpa memengaruhi struktur atau aktivitasnya. Di sini, sebuah “penanda” yang terdiri dari urutan asam amino tertentu, biasanya serangkaian residu histidin (sebuah “penanda-His”), dilampirkan ke salah satu ujung protein.

Akibatnya, ketika lisat dilewatkan ke kolom kromatografi yang mengandung nikel, residu histidin mengikat nikel dan menempel pada kolom, sementara komponen lisat yang tidak diberi tanda lewat tanpa hambatan. Sejumlah tag berbeda telah dikembangkan untuk membantu peneliti memurnikan protein tertentu dari campuran yang kompleks.

[67] Lokalisasi seluler [sunting - sunting sumber ] Studi tentang poly peptide in vivo sering kali berkaitan dengan sintesis dan lokalisasi protein di dalam sel. Meskipun banyak protein intraseluler disintesis dalam sitoplasma dan protein-terikat-membran atau protein-tersekresi di retikulum endoplasma (RE), cara spesifik tentang bagaimana protein ditargetkan ke organel atau struktur seluler tertentu sering kali tidak jelas.

Teknik yang berguna untuk menilai lokalisasi seluler adalah menggunakan rekayasa genetika untuk mengekspresikan di dalam sel, suatu protein fusi atau kimera yang terdiri dari poly peptide alami yang diinginkan yang dihubungkan dengan “pelapor” seperti protein berpendar hijau (GFP).

[68] Posisi protein yang menyatu di dalam sel dapat divisualisasikan dengan bersih dan efisien menggunakan mikroskop, seperti yang ditunjukkan pada gambar.

[69] Metode lain untuk menjelaskan lokasi seluler dari protein memerlukan penggunaan penanda kompartemen untuk daerah seperti RE, badan Golgi, lisosom atau vakuola, mitokondria, kloroplas, membran plasma, dan lainnya.

Dengan penggunaan penanda berpendar (fluoresen) atau antibodi terhadap penanda, identifikasi lokalisasi protein yang diinginkan akan menjadi lebih mudah. Misalnya, imunofluoresensi tidak langsung akan memungkinkan kolokalisasi fluoresensi dan demonstrasi lokasi. Pewarna fluoresen digunakan untuk memberi label pada kompartemen seluler untuk tujuan yang sama. [70] Kemungkinan lain juga ada. Misalnya imunohistokimia biasanya menggunakan antibodi terhadap satu protein yang diinginkan atau lebih, dinding sel bakteri tersusun atas persenyawaan antara polisakarida dan protein dikonjugasikan ke enzim yang menghasilkan sinyal bercahaya atau kromogenik yang dapat dibandingkan antarsampel, sehingga memungkinkan informasi lokalisasi.

Teknik lain yang dapat diterapkan adalah kofraksionasi dalam gradien sukrosa (atau bahan lain) menggunakan sentrifugasi isopiknik. [71] Meskipun teknik ini tidak membuktikan kolokalisasi kompartemen dengan kepadatan yang diketahui dan protein yang diinginkan, teknik ini meningkatkan kemungkinan, dan lebih dapat diterima untuk penelitian skala besar. Metode standar emas untuk lokalisasi seluler adalah mikroskop imunoelektron. Teknik ini juga menggunakan antibodi terhadap protein yang diinginkan, yang menggunakan teknik mikroskop elektron klasik.

Sampel disiapkan untuk pemeriksaan mikroskopis elektron normal dan kemudian diberi antibodi terhadap protein yang diinginkan yang dikonjugasikan ke bahan yang sangat padat-elektro, biasanya emas. Hal ini memungkinkan untuk lokalisasi, baik detail ultrastruktur maupun protein yang diinginkan. [72] Melalui penerapan rekayasa genetika lain yang dikenal sebagai mutagenesis-terarah-situs, para peneliti dapat mengubah urutan protein dan strukturnya, lokalisasi seluler, serta kerentanannya terhadap regulasi.

Teknik ini bahkan memungkinkan penggabungan asam amino yang tidak alami ke dalam protein menggunakan tRNA yang dimodifikasi, [73] dan memungkinkan desain rasional protein baru dengan sifat baru. [74] Proteomika [sunting - sunting sumber ] Jumlah komplemen protein yang ada pada suatu waktu dalam sel atau jenis sel dikenal sebagai proteoma, dan studi tentang kumpulan data berskala besar tersebut yaitu proteomika, yang dinamai sesuai dengan analoginya dalam genom yaitu genomika.

Teknik eksperimental utama dalam proteomika meliputi elektroforesis 2nd [75] yang memungkinkan pemisahan banyak protein, spektrometri massa [76] yang memungkinkan identifikasi poly peptide dengan kecepatan tinggi dan pengurutan peptida dengan cepat (paling sering setelah pencernaan dalam gel), protein susunan-mikro yang memungkinkan deteksi jumlah berbagai poly peptide yang ada dalam sel secara relatif, dan penapisan dua-hibrid yang memungkinkan eksplorasi sistematis interaksi protein-poly peptide.

[77] Jumlah komplemen yang mungkin secara biologis dari interaksi-interaksi semacam itu dikenal sebagai interaksioma. Upaya sistematis untuk menentukan struktur protein yang mewakili setiap kemungkinan lipatan dikenal sebagai genomika struktural.

[78] Bioinformatika [sunting - sunting sumber ] Berbagai macam metode komputasi telah dikembangkan untuk menganalisis struktur, fungsi, dan evolusi poly peptide. Perkembangan metode-metode tersebut didorong oleh sejumlah besar data genomik dan proteomik yang tersedia untuk berbagai organisme, termasuk genom manusia.

Tidak mungkin mempelajari semua protein secara eksperimental sehingga hanya sedikit protein yang menjadi sasaran eksperimen laboratorium. Sementara itu, alat komputasi digunakan untuk mengekstrapolasi ke poly peptide yang serupa. Poly peptide homolog dapat diidentifikasi secara efisien pada organisme yang berkerabat jauh melalui penjajaran urutan.

Urutan-urutan genom dan gen dapat dicari dengan berbagai alat untuk properti tertentu. Alat pembuat profil urutan dapat menemukan situs enzim restriksi, rangka baca terbuka dalam urutan nukleotida, dan memprediksi struktur sekunder poly peptide. Pohon filogenetika dapat dibuat dan hipotesis evolusi dikembangkan menggunakan perangkat lunak khusus seperti ClustalW untuk mengetahui nenek moyang organisme modernistic dan gen yang mereka ekspresikan.

Bidang bioinformatika sangat diperlukan untuk analisis gen dan protein. Penentuan struktur [sunting - sunting sumber ] Penemuan struktur tersier dari suatu protein, atau struktur kuaterner dari kompleks protein, dapat memberikan petunjuk penting tentang bagaimana protein tersebut menjalankan fungsinya dan bagaimana fungsi ini dapat dipengaruhi, misalnya dalam mendesain obat. Karena protein terlalu kecil untuk dilihat di bawah mikroskop cahaya, metode lain harus digunakan untuk menentukan strukturnya.

Metode eksperimental yang umum meliputi kristalografi sinar-10 dan spektroskopi NMR, keduanya dapat menghasilkan informasi struktural pada resolusi dinding sel bakteri tersusun atas persenyawaan antara polisakarida dan protein.

Eksperimen NMR mampu memberikan informasi dari mana subset jarak di antara pasangan atom dapat diperkirakan, dan kemungkinan konformasi akhir sebuah protein ditentukan dengan memecahkan masalah geometri jarak.

Interferometri polarisasi ganda adalah metode analitik kuantitatif untuk mengukur konformasi poly peptide secara keseluruhan dan perubahan konformasi akibat interaksi atau rangsangan lainnya. Dikroisme sirkuler adalah teknik laboratorium lain untuk menentukan komposisi untiran-alfa atau lembaran-beta internal dari poly peptide. Mikroskop krioelektron digunakan untuk menghasilkan informasi struktural beresolusi rendah tentang kompleks protein yang sangat besar, termasuk virus yang telah dirakit; [79] varian yang dikenal sebagai kristalografi elektron juga dapat menghasilkan informasi resolusi tinggi dalam beberapa kasus, terutama untuk kristal protein membran dua dimensi.

[80] Struktur yang diselesaikan biasanya disimpan di Bank Information Protein (PDB), sumber daya yang tersedia secara bebas mengenai data struktural dari ribuan protein yang dapat diperoleh dalam bentuk koordinat Cartesian untuk setiap atom dalam protein.

[81] Urutan gen lebih banyak diketahui dibandingkan struktur poly peptide. Lebih jauh, himpunan struktur protein yang terselesaikan cenderung bias terhadap poly peptide yang dapat dengan mudah mengalami kondisi yang diperlukan untuk kristalografi sinar-X, salah satu metode utama penentuan struktur protein.

Secara khusus, protein globular secara komparatif mudah untuk mengkristal sebagai persiapan untuk kristalografi sinar-X. Sebaliknya, protein membran dan kompleks protein besar sulit untuk dikristalisasi dan kurang terwakili dalam PDB. [82] Genomika struktural telah berusaha untuk memperbaiki kekurangan ini dengan secara sistematis memecahkan struktur perwakilan dari kelas-kelas lipatan utama. Metode prediksi struktur protein mencoba mencari cara untuk menghasilkan struktur yang masuk akal untuk protein yang strukturnya belum ditentukan secara eksperimental.

[83] Prediksi dan simulasi struktur [sunting - sunting sumber ] Asam [ pranala nonaktif permanen ] amino-asam amino penyusun dapat dianalisis untuk memprediksi struktur poly peptide sekunder, tersier, dan kuaterner, dalam hal ini hemoglobin yang mengandung unit heme.

Untuk melengkapi bidang genomika struktural, prediksi struktur protein mengembangkan model matematika protein yang efisien untuk memprediksi formasi molekul secara komputasi dalam teori, alih-alih mendeteksi struktur dengan observasi laboratorium.

[84] Jenis prediksi struktur yang paling berhasil, yang dikenal sebagai pemodelan homologi, bergantung pada keberadaan struktur “templat” dengan kemiripan urutan terhadap protein yang dimodelkan; tujuan genomika struktural adalah memberikan representasi yang memadai dari struktur yang terselesaikan untuk memodelkan sebagian besar struktur yang tersisa.

[85] Meskipun menghasilkan model yang akurat tetap menjadi tantangan ketika yang tersedia hanyalah struktur templat yang berkaitan jauh, disimpulkan bahwa penyelarasan urutan adalah penghambat dalam proses ini karena model yang cukup akurat dapat dihasilkan jika penyelarasan urutan yang “sempurna” diketahui.

[86] Banyak metode prediksi struktur telah menyediakan informasi bagi bidang rekayasa protein, yang baru-baru ini muncul, ketika lipatan protein yang baru telah dirancang. [87] Masalah komputasi yang lebih kompleks yaitu prediksi interaksi antarmolekul, seperti dalam perkaitan molekuler dan prediksi interaksi protein-protein. [88] Model matematika untuk mensimulasikan proses dinamis dari pelipatan dan pengikatan protein melibatkan mekanika molekuler, khususnya dinamika molekuler.

Teknik Monte Carlo memfasilitasi komputasi, yang memanfaatkan kemajuan dalam komputasi paralel dan terdistribusi (misalnya proyek Folding@home [89] yang melakukan pemodelan molekuler pada GPU). Simulasi in silico menemukan lipatan domain protein uliran-alfa yang kecil seperti bagian-kepala poly peptide vilin [90] dan protein aksesori HIV. [91] Metode hibrida yang menggabungkan dinamika molekul standar dengan matematika mekanika kuantum telah menjelajahi keadaan elektronik rhodopsin.

[92] Gangguan protein dan prediksi tidak terstruktur [sunting - sunting sumber ] Banyak protein (pada eukariota ~33%) mengandung segmen besar yang tidak terstruktur tetapi berfungsi secara biologis dan dapat diklasifikasikan sebagai poly peptide yang tidak teratur secara intrinsik. [93] Oleh karena itu, memprediksi dan menganalisis kelainan poly peptide merupakan bagian penting dari karakterisasi struktur poly peptide.

[94] Nutrisi [sunting - sunting sumber ] Kebanyakan mikroorganisme dan tumbuhan dapat melakukan biosintesis untuk menghasilkan semua 20 asam amino standar, sedangkan hewan (termasuk manusia) harus memperoleh beberapa asam amino dari makanan. [95] Asam amino-asam amino yang tidak dapat disintesis sendiri oleh organisme disebut sebagai asam amino esensial.

Enzim kunci yang menyintesis asam amino tertentu tidak terdapat pada hewan—seperti aspartokinase, yang mengkatalisis langkah pertama dalam sintesis lisin, metionin, dan treonin dari aspartat. Jika asam amino ada di lingkungan, mikroorganisme dapat menghemat energi dengan mengambil asam amino dari lingkungannya dan menurunkan jalur biosintetiknya.

Pada hewan, asam amino diperoleh melalui konsumsi makanan yang mengandung protein. Protein yang tertelan kemudian dipecah menjadi asam amino melalui pencernaan, yang biasanya melibatkan denaturasi protein melalui paparan asam dan hidrolisis oleh enzim yang disebut protease. Beberapa asam amino yang dicerna digunakan untuk biosintesis protein, sementara yang lain diubah menjadi glukosa melalui glukoneogenesis, atau dimasukkan ke dalam siklus asam sitrat.

Penggunaan protein sebagai bahan bakar sangat penting dalam kondisi kelaparan karena memungkinkan protein tubuh digunakan untuk menyokong kehidupan, terutama protein yang ditemukan di otot. [96] Pada hewan seperti anjing dan kucing, protein menjaga kesehatan dan kualitas kulit dengan mendorong pertumbuhan folikel rambut dan keratinisasi sehingga mengurangi kemungkinan munculnya bau busuk pada kulit.

[97] Protein berkualitas buruk juga berperan dalam kesehatan saluran cerna dengan meningkatkan potensi perut kembung dan senyawa berbau pada anjing karena ketika protein mencapai usus besar dalam keadaan tidak tercerna, mereka difermentasi menghasilkan gas hidrogen sulfida, indol, dan skatol. [98] Anjing dan kucing mencerna protein hewani lebih baik dibandingkan poly peptide nabati, tetapi produk hewani berkualitas dinding sel bakteri tersusun atas persenyawaan antara polisakarida dan protein dicerna dengan buruk, termasuk kulit, bulu, dan jaringan ikat.

[98] Kekurangan protein bisa mengakibatkan kerontokan rambut (rambut terdiri dari 97-100% dari keratin) hingga busung lapar, penyakit kekurangan protein.

[99] Kekurangan protein yang terus menerus menyebabkan marasmus dan berkibat kematian. Studi dari Biokimiawan U.s. Thomas Osborne Lafayete Mendel, Profesor untuk biokimia di Yale, 1914, mengujicobakan protein konsumsi dari daging dan tumbuhan kepada dinding sel bakteri tersusun atas persenyawaan antara polisakarida dan protein.

Satu grup kelinci-kelinci tersebut diberikan makanan protein hewani, sedangkan grup yang lain diberikan poly peptide nabati. Dari eksperimennya didapati bahwa kelinci yang memperoleh protein hewani lebih cepat bertambah beratnya dari kelinci yang memperoleh protein nabati. Kemudian studi selanjutnya, oleh McCay dari Universitas Berkeley menunjukkan bahwa kelinci yang memperoleh poly peptide nabati, lebih sehat dan hidup dua kali lebih lama. [ butuh rujukan] Analisis kimia [sunting - sunting sumber ] Jumlah kandungan nitrogen dari bahan organik terutama dibentuk oleh gugus amino dalam protein.

Total Kjeldahl Nitrogen (TKN) adalah ukuran nitrogen yang banyak digunakan dalam analisis air (limbah), tanah, makanan, pakan, dan bahan organik secara umum. Seperti namanya, metode Kjeldahl diterapkan untuk menganalisisnya. Meskipun demikian, metode lain yang lebih sensitif juga tersedia.

[100] [101] • ^ Thomas Burr Osborne (1909): The Vegetable ProteinsHistory pp 1 to half-dozen, dari archive.org • ^ Mulder GJ (1838). “Sur la limerick de quelques substances animales”. Bulletin des Sciences Physiques et Naturelles en Néerlande: 104. • ^ Harold, Hartley (1951). “Origin of the Word ‘Protein. ‘“. Nature. 168 (4267): 244. Bibcode:1951Natur.168.244H. doi:ten.1038/168244a0.

PMID 14875059. • ^ a b c Perrett D (August 2007).

“From ‘protein’ to the beginnings of clinical proteomics”. Proteomics: Clinical Applications. 1 (8): 720–38. doi:10.1002/prca.200700525. PMID 21136729. • ^ New Oxford Lexicon of English language • ^ Reynolds JA, Tanford C (2003). Nature’south Robots: A History of Proteins (Oxford Paperbacks). New York, New York: Oxford University Printing. hlm. 15. ISBN 978-0-xix-860694-nine. • ^ Reynolds and Tanford (2003).

• ^ Bischoff TL, Voit C (1860). Die Gesetze der Ernaehrung des Pflanzenfressers durch neue Untersuchungen festgestellt (dalam bahasa Jerman). Leipzig, Heidelberg. • ^ “Hofmeister, Franz”. encyclopedia.com. Diarsipkan dari versi asli tanggal five April 2017. Diakses tanggal 4 April 2017. • ^ “Protein, section: Classification of protein”. britannica.com. Diarsipkan dari versi asli tanggal 4 April 2017. Diakses tanggal iv Apr 2017.

• ^ Sumner JB (1926). “The isolation and crystallization of the enzyme urease. Preliminary paper”. Journal of Biological Chemistry. 69 (2): 435–41. Diarsipkan dari versi asli (PDF) tanggal 2011-03-25.

Diakses tanggal 2011-01-16. • ^ Pauling L, Corey RB (May 1951). “Atomic coordinates and structure factors for two helical configurations of polypeptide chains” (PDF). Proceedings of the National Academy of Sciences of the United states of America. 37 (five): 235–40. Bibcode:1951PNAS…37.235P. doi:10.1073/pnas.37.five.235. PMC 1063348. PMID 14834145. Diarsipkan dari versi asli (PDF) tanggal 2012-11-28.

Diakses tanggal 2009-04-14. • ^ Kauzmann Due west (May 1956). “Structural factors in protein denaturation”. Journal of Cellular Physiology. 47 (Suppl 1): 113–31. doi:x.1002/jcp.1030470410. PMID 13332017. • ^ Kauzmann W (1959). “Some factors in the interpretation of poly peptide denaturation”. Advances in Protein Chemistry Volume 14.

Advances in Poly peptide Chemical science. 14. hlm. one–63. doi:10.1016/S0065-3233(08)60608-7. ISBN 978-0-12-034214-3. PMID 14404936. • ^ Kalman SM, Linderstrøm-Lang Thousand, Ottesen M, Richards FM (Feb 1955). “Degradation of ribonuclease past subtilisin”. Biochimica et Biophysica Acta. xvi (2): 297–99. doi:10.1016/0006-3002(55)90224-ix. PMID 14363272.

• ^ Sanger F (1949). “The terminal peptides of insulin”. The Biochemical Periodical. 45 (5): 563–74. doi:10.1042/bj0450563. PMC 1275055. PMID 15396627. • ^ Sanger F. (1958), Nobel lecture: The chemistry of insulin (PDF), Nobelprize.org, diarsipkan dari versi asli (PDF) tanggal 2013-01-05diakses tanggal 2016-02-09 • ^ Muirhead H, Perutz MF (August 1963). “Structure dinding sel bakteri tersusun atas persenyawaan antara polisakarida dan protein hemoglobin.

A three-dimensional fourier synthesis of reduced homo hemoglobin at 5.v Å resolution”. Nature. 199 (4894): 633–38. Bibcode:1963Natur.199.633M. doi:x.1038/199633a0. PMID 14074546. • ^ Kendrew JC, Bodo Chiliad, Dintzis HM, Parrish RG, Wyckoff H, Phillips DC (March 1958).

“A three-dimensional model of the myoglobin molecule obtained by 10-ray analysis”. Nature. 181 (4610): 662–66. Bibcode:1958Natur.181.662K. doi:ten.1038/181662a0. PMID 13517261. • ^ “RCSB Protein Information Bank”. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2015-04-18. Diakses tanggal 2017-01-19. • ^ Zhou ZH (April 2008). “Towards atomic resolution structural decision by single-particle cryo-electron microscopy”.

Current Opinion in Structural Biology. eighteen (2): 218–28. doi:10.1016/j.sbi.2008.03.004. PMC 2714865. PMID 18403197. • ^ Keskin O, Tuncbag Due north, Gursoy A (April 2008). “Characterization and prediction of protein interfaces to infer poly peptide-protein interaction networks”.

Current Pharmaceutical Biotechnology. ix (2): 67–76. doi:10.2174/138920108783955191. PMID 18393863.

• ^ Nelson DL, Cox MM (2005). Lehninger’due south Principles of Biochemistry (edisi ke-four). New York, New York: West. H. Freeman and Visitor.

• ^ Gutteridge A, Thornton JM (November 2005). “Agreement nature’s catalytic toolkit”. Trends in Biochemical Sciences. thirty (11): 622–29. doi:10.1016/j.tibs.2005.09.006. PMID 16214343. • ^ Murray et al., p.

19. • ^ Ardejani, Maziar South.; Powers, Evan T.; Kelly, Jeffery W. (2017). “Using Cooperatively Folded Peptides To Measure Interaction Energies and Conformational Propensities”. Accounts of Chemical Research. 50 (eight): 1875–82. doi:ten.1021/acs.accounts.7b00195. ISSN 0001-4842. PMC 5584629. PMID 28723063. • ^ Branden C, Tooze J (1999). Introduction to Protein Structure. New York: Garland Pub. ISBN 978-0-8153-2305-1. • ^ Murray RF, Harper HW, Granner DK, Mayes PA, Rodwell VW (2006).

Harper’s Illustrated Biochemistry. New York: Lange Medical Books/McGraw-Colina. ISBN 978-0-07-146197-ix. • ^ Van Holde KE, Mathews CK (1996). Biochemistry. Menlo Park, California: Benjamin/Cummings Pub. Co., Inc. ISBN 978-0-8053-3931-four. • ^ Milo R (December 2013). “What is the total number of protein molecules per prison cell volume? A call to rethink some published values”. BioEssays. 35 (12): 1050–55. doi:10.1002/bies.201300066. PMC 3910158. PMID 24114984. • ^ Beck Yard, Schmidt A, Malmstroem J, Claassen M, Ori A, Szymborska A, Herzog F, Rinner O, Ellenberg J, Aebersold R (Nov 2011).

“The quantitative proteome of a human jail cell line”. Molecular Systems Biological science. 7: 549. doi:ten.1038/msb.2011.82. Dinding sel bakteri tersusun atas persenyawaan antara polisakarida dan protein 3261713. PMID 22068332. • ^ Wu L, Candille SI, Choi Y, Xie D, Jiang Fifty, Li-Pook-Than J, Tang H, Snyder Thou (July 2013).

“Variation and genetic control of poly peptide affluence in humans”. Nature. 499 (7456): 79–82. Bibcode:2013Natur.499…79W. doi:10.1038/nature12223. PMC 3789121. PMID 23676674. • ^ a b van Holde and Mathews, pp. 1002–42. • ^ Dobson CM (2000). “The nature and significance of protein folding”.

Dalam Pain RH. Mechanisms of Protein Folding. Oxford, Oxfordshire: Oxford University Printing. hlm. 1–28. ISBN 978-0-19-963789-8. • ^ Kozlowski LP (January 2017). “Proteome-pI: proteome isoelectric point database”. Nucleic Acids Research.

45 (D1): D1112–D1116. doi:10.1093/nar/gkw978. PMC 5210655. PMID 27789699. • ^ Fulton AB, Isaacs WB (April 1991). “Titin, a huge, rubberband sarcomeric protein with a probable role in morphogenesis”. BioEssays. 13 (4): 157–61. doi:10.1002/bies.950130403. PMID 1859393. • ^ Bruckdorfer T, Marder O, Albericio F (February 2004). “From product of peptides in milligram amounts for enquiry to multi-tons quantities for drugs of the hereafter”.

Electric current Pharmaceutical Biotechnology. 5 (1): 29–43. doi:10.2174/1389201043489620. PMID 14965208. • ^ Schwarzer D, Cole PA (December 2005).

“Protein semisynthesis and expressed poly peptide ligation: chasing a protein’s tail”. Current Stance in Chemical Biology. 9 (half-dozen): 561–69. doi:x.1016/j.cbpa.2005.09.018. PMID 16226484. • ^ Kent SB (Feb 2009). “Full chemical synthesis of proteins”.

Chemical Social club Reviews. 38 (2): 338–51. doi:10.1039/b700141j. PMID 19169452. • ^ Murray et al., p. 36.

• ^ Murray et al., p. 37. • ^ Murray et al., pp. 30–34. • ^ Paustian T. 2001. Protein Structure. University of Wisconsin-Madison. http://lecturer.ukdw.air-conditioning.id/dhira/BacterialStructure/Proteins.html. Diakses pada 5 Mei 2010.

• ^ Pribic R, Stokkum van IH, Chapman D, Haris PI, Bloemendal M. 1993. Poly peptide secondary structure from Fourier transform infrared and/or circular dichroism spectra.

Anal Biochem 214(two):366-78. • ^ van Holde and Mathews, pp. 368–75. • ^ van Holde and Mathews, pp. 165–85. • ^ Fernández A, Scott R (September 2003). “Dehydron: a structurally encoded point for poly peptide interaction”. Biophysical Journal. 85 (3): 1914–28. Bibcode:2003BpJ….85.1914F. doi:10.1016/S0006-3495(03)74619-0. PMC 1303363. PMID 12944304. • ^ Davey NE, Van Roey K, Weatheritt RJ, Toedt G, Uyar B, Altenberg B, Budd A, Diella F, Dinkel H, Gibson TJ (January 2012). “Attributes of short linear motifs”.

Molecular BioSystems. 8 (1): 268–81. doi:10.1039/c1mb05231d. PMID 21909575. • ^ Lodish H, Berk A, Matsudaira P, Kaiser CA, Krieger One thousand, Scott MP, Zipurksy SL, Darnell J (2004).

Molecular Cell Biology (edisi ke-5th). New York, New York: WH Freeman and Company. • ^ Voet D, Voet JG. (2004). Biochemistry Vol 1 3rd ed. Wiley: Hoboken, NJ. • ^ Sankaranarayanan R, Moras D (2001). “The fidelity of the translation of the genetic code”. Acta Biochimica Polonica. 48 (ii): 323–35. doi: 10.18388/abp.2001_3918. PMID 11732604. • ^ van Holde dan Mathews, pp.

830–49. • ^ Copland JA, Sheffield-Moore One thousand, Koldzic-Zivanovic N, Gentry S, Lamprou M, Tzortzatou-Stathopoulou F, Zoumpourlis V, Urban RJ, Vlahopoulos SA dinding sel bakteri tersusun atas persenyawaan antara polisakarida dan protein 2009). “Sex steroid receptors in skeletal differentiation and epithelial neoplasia: is tissue-specific intervention possible?”.

BioEssays. 31 (6): 629–41. doi:10.1002/bies.200800138. PMID 19382224. • ^ Samarin South, Nusrat A (January 2009). “Regulation of epithelial upmost junctional complex by Rho family GTPases”. Frontiers in Bioscience. 14 (14): 1129–42. doi:10.2741/3298. PMID 19273120. • ^ Bairoch A (January 2000).

“The ENZYME database in 2000” (PDF). Nucleic Acids Inquiry. 28 (1): 304–05. doi:ten.1093/nar/28.ane.304. PMC 102465. PMID 10592255. Diarsipkan dari versi asli (PDF) tanggal June ane, 2011. • ^ Radzicka A, Wolfenden R (January 1995). “A proficient enzyme”. Science. 267 (5194): 90–three.

Bibcode:1995Sci…267…90R. doi:10.1126/scientific discipline.7809611. PMID 7809611. • ^ Pickel B, Schaller A (October 2013). “Dirigent proteins: molecular characteristics and potential biotechnological applications”. Applied Microbiology and Biotechnology. 97 (xix): 8427–38. doi:10.1007/s00253-013-5167-4. PMID 23989917. • ^ Branden dan Tooze, pp. 251–281. • ^ van Holde and Mathews, pp. 247–fifty. • ^ van Holde and Mathews, pp. 220–29. • ^ Rüdiger H, Siebert HC, Solís D, Jiménez-Barbero J, Romero A, von der Lieth CW, Diaz-Mariño T, Gabius HJ (April 2000).

“Medicinal chemistry based on the sugar lawmaking: fundamentals of lectinology and experimental strategies with lectins equally targets”. Current Medicinal Chemistry. 7 (4): 389–416. doi:10.2174/0929867003375164. PMID 10702616. • ^ Branden and Tooze, pp. 232–34. • ^ van Holde and Mathews, pp. 178–81. • ^ van Holde and Mathews, pp. 258–64, 272. • ^ Murray et al., pp. 21–24.

• ^ Hey J, Posch A, Cohen A, Liu Due north, Harbers A (2008). “Fractionation of complex protein mixtures by liquid-phase isoelectric focusing”. 2D PAGE: Sample Preparation and Fractionation. Methods in Molecular Biological science. Methods in Molecular Biology™. 424. hlm. 225–39. doi:ten.1007/978-1-60327-064-9_19. ISBN 978-1-58829-722-8.

PMID 18369866. • ^ Terpe Chiliad (January 2003).

“Overview of tag poly peptide fusions: from molecular and biochemical fundamentals to commercial systems”. Practical Microbiology and Biotechnology. 60 (5): 523–33. doi:x.1007/s00253-002-1158-6. PMID 12536251. • ^ Stepanenko OV, Verkhusha VV, Kuznetsova IM, Uversky VN, Turoverov KK (August 2008). “Fluorescent proteins as biomarkers and biosensors: throwing colour lights on molecular and cellular processes”.

Electric current Poly peptide & Peptide Science. 9 (four): 338–69. doi:ten.2174/138920308785132668. PMC 2904242. PMID 18691124. • ^ Yuste R (December 2005). “Fluorescence microscopy today”. Nature Methods. 2 (12): 902–4. doi:x.1038/nmeth1205-902. PMID 16299474. • ^ Margolin W (January 2000). “Green fluorescent protein equally a reporter for macromolecular localization in bacterial cells”.

Methods. 20 (i): 62–72. dinding sel bakteri tersusun atas persenyawaan antara polisakarida dan protein. PMID 10610805. • ^ Walker JH, Wilson Chiliad (2000). Principles and Techniques of Practical Biochemistry. Cambridge, Uk: Cambridge University Press. hlm. 287–89. ISBN 978-0-521-65873-7. • ^ Mayhew TM, Lucocq JM (Baronial 2008). “Developments in cell biology for quantitative immunoelectron microscopy based on thin sections: a review”. Histochemistry and Cell Biology.

130 (2): 299–313. doi:10.1007/s00418-008-0451-half-dozen. PMC 2491712. PMID 18553098. • ^ Hohsaka T, Sisido One thousand (December 2002). “Incorporation of non-natural amino acids into proteins”. Current Opinion in Chemic Biology. 6 (6): 809–15. doi:10.1016/S1367-5931(02)00376-ix.

PMID 12470735. • ^ Cedrone F, Ménez A, Quéméneur Due east (August 2000). “Tailoring new enzyme functions by rational redesign”. Current Stance in Structural Biology. ten (4): 405–10. doi:10.1016/S0959-440X(00)00106-8. PMID 10981626. • ^ Görg A, Weiss W, Dunn MJ (December 2004). “Electric current 2-dimensional electrophoresis applied science for proteomics”. Proteomics. 4 (12): 3665–85. doi:x.1002/pmic.200401031.

PMID 15543535. • ^ Conrotto P, Souchelnytskyi Southward (September 2008). “Proteomic approaches in biological and medical sciences: principles and applications”. Experimental Oncology. 30 (3): 171–eighty. PMID 18806738. • ^ Koegl M, Uetz P (Dec 2007). “Improving yeast 2-hybrid screening systems”. Briefings in Functional Genomics & Proteomics. 6 (4): 302–12. doi: 10.1093/bfgp/elm035. PMID 18218650. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2017-09-11.

Diakses tanggal 2017-07-23. • ^ Zhang C, Kim SH (February 2003). “Overview of structural genomics: from structure to part”. Electric current Opinion in Chemic Biology. 7 (1): 28–32.

doi:10.1016/S1367-5931(02)00015-7. PMID 12547423. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2018-11-19. Diakses tanggal 2019-06-29. • ^ Branden and Tooze, pp. 340–41. • ^ Gonen T, Cheng Y, Sliz P, Hiroaki Y, Fujiyoshi Y, Harrison SC, Walz T (December 2005).

“Lipid-protein interactions in double-layered 2-dimensional AQP0 crystals”. Nature. 438 (7068): 633–38. Bibcode:2005Natur.438.633G. doi:10.1038/nature04321. PMC 1350984.

PMID 16319884. • ^ Standley DM, Kinjo AR, Kinoshita Grand, Nakamura H (July 2008). “Poly peptide structure databases with new web services for structural biological science and biomedical enquiry”.

Briefings in Bioinformatics. 9 (4): 276–85. doi: ten.1093/bib/bbn015. PMID 18430752. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2013-04-fifteen. Diakses tanggal 2009-04-13. • ^ Walian P, Cross TA, Jap BK (2004). “Structural genomics of membrane proteins”. Genome Biology. 5 (4): 215. doi:x.1186/gb-2004-5-4-215. PMC 395774. PMID 15059248. • ^ Sleator RD (2012). “Prediction of protein functions”.

Functional Genomics. Methods in Molecular Biology. 815. hlm. 15–24. doi:ten.1007/978-1-61779-424-7_2. ISBN 978-1-61779-423-0. PMID 22130980. • ^ Zhang Y (June 2008). “Progress and challenges in poly peptide structure prediction”. Current Opinion in Structural Biology. eighteen (3): 342–48.

doi:ten.1016/j.sbi.2008.02.004. PMC 2680823. PMID 18436442. • ^ Xiang Z (June 2006). “Advances in homology protein structure modeling”. Current Poly peptide & Peptide Scientific discipline. 7 (iii): 217–27. doi:10.2174/138920306777452312. PMC 1839925. PMID 16787261. • ^ Zhang Y, Skolnick J (January 2005). “The protein construction prediction trouble could exist solved using the current PDB library”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the The states.

102 (4): 1029–34. Bibcode:2005PNAS.102.1029Z. doi:10.1073/pnas.0407152101. PMC 545829. PMID 15653774. • dinding sel bakteri tersusun atas persenyawaan antara polisakarida dan protein Kuhlman B, Dantas G, Ireton GC, Varani Thou, Stoddard BL, Bakery D (November 2003). “Pattern of a novel globular protein fold with atomic-level accurateness”. Scientific discipline.

302 (5649): 1364–68. Bibcode:2003Sci…302.1364K. doi:10.1126/science.1089427. PMID 14631033. • ^ Ritchie DW (February 2008). “Recent progress and future directions in protein-poly peptide docking”. Current Protein & Peptide Science. 9 (1): 1–15. CiteSeerX ten.ane.i.211.4946. doi:ten.2174/138920308783565741. PMID 18336319. • ^ Scheraga HA, Khalili M, Liwo A (2007). “Protein-folding dynamics: overview of molecular simulation techniques”. Annual Review of Physical Chemical science. 58: 57–83.

Bibcode:2007ARPC…58…57S. doi:10.1146/annurev.physchem.58.032806.104614. PMID 17034338. • ^ Zagrovic B, Snow CD, Shirts MR, Pande VS (November 2002). “Simulation of folding of a small alpha-helical protein in atomistic detail using worldwide-distributed computing”. Periodical of Molecular Biological science. 323 (5): 927–37. CiteSeerX ten.ane.1.142.8664.

doi:x.1016/S0022-2836(02)00997-10. PMID 12417204. • ^ Herges T, Wenzel W (January 2005). “In silico folding of a three helix protein and characterization of its complimentary-energy landscape in an all-atom force field”. Physical Review Letters. 94 (1): 018101. arXiv: physics/0310146. Bibcode:2005PhRvL.94a8101H. doi:10.1103/PhysRevLett.94.018101. PMID 15698135. • ^ Hoffmann G, Wanko M, Strodel P, König PH, Frauenheim T, Schulten Thousand, Thiel W, Tajkhorshid Eastward, Elstner M (August 2006).

“Colour tuning in rhodopsins: the machinery for the spectral shift between bacteriorhodopsin and sensory rhodopsin II”. Periodical of the American Chemical Society. 128 (33): 10808–eighteen. doi:10.1021/ja062082i. PMID 16910676. • ^ Ward JJ, Sodhi JS, McGuffin LJ, Buxton BF, Jones DT (March 2004). “Prediction and functional analysis of native disorder in proteins from the iii kingdoms of life”.

Journal of Molecular Biology. 337 (iii): 635–45. doi:10.1016/j.jmb.2004.02.002. PMID 15019783. • ^ Tompa, Peter; Fersht, Alan (18 November 2009). Structure and Part of Intrinsically Disordered Proteins. CRC Press. ISBN 978-i-4200-7893-0. Diarsipkan dari versi asli tanggal 19 April 2017. Diakses tanggal 19 October 2016. • ^ Voet D, Voet JG. (2004). Biochemistry Vol 1 tertiary ed.

Wiley: Hoboken, NJ. • ^ Brosnan JT (June 2003). “Interorgan amino acid transport and its regulation”. The Journal of Nutrition. 133 (half-dozen Suppl 1): 2068S–72S.

doi: 10.1093/jn/133.6.2068S. PMID 12771367. • ^ Watson TD (1998). “Diet and peel disease in dogs and cats”. The Journal of Nutrition. 128 (12 Suppl): 2783S–89S. doi:10.1093/jn/128.12.2783S. PMID 9868266. • ^ a b Case LP, Daristotle 50, Hayek MG, Raasch MF (2010).

Canine and Feline Nutrition-East-Book: A Resource for Companion Animal Professionals.

Elsevier Wellness Sciences. • ^ Prasanna HA, Desai BLM, Rao MN. 1971. Detection of early protein-calorie malnutrition (pre-kwashiorkor) in population groups. British J Nutr 26:71-74. • ^ Muñoz-Huerta et al.

(2013) A Review of Methods for Sensing the Nitrogen Status in Plants: Advantages, Disadvantages and Recent Advances • ^ Martin et al. (2002) Determination of soil organic carbon and nitrogen at thefield level using well-nigh-infrared spectroscopy • Branden C, Tooze J (1999). Introduction to Protein Structure. New York: Garland Pub. ISBN 978-0-8153-2305-1. • Murray RF, Harper HW, Granner DK, Mayes PA, Rodwell VW (2006). Harper’s Illustrated Biochemistry. New York: Lange Medical Books/McGraw-Hill.

ISBN 978-0-07-146197-9. • Van Holde KE, Mathews CK (1996). Biochemistry. Menlo Park, California: Benjamin/Cummings Pub. Co., Inc. ISBN 978-0-8053-3931-iv. Pranala luar [sunting - sunting sumber ] Wikimedia Commons memiliki media mengenai Protein. Ground data dan proyek [sunting - sunting sumber ] • Basis data protein NCBI Entrez • Basis data struktur protein NCBI • Footing data referensi protein manusia • Proteinpedia manusia • Folding@Habitation (Universitas Stanford) Diarsipkan 2012-09-21 di WebCite • Bank Data Poly peptide di Eropa (lihat pula PDBeQuips [ pranala nonaktif permanen ]artikel singkat dan panduan tentang struktur PDB yang menarik) • Enquiry Collaboratory for Structural Bioinformatics (lihat pula Molecule of the Month Diarsipkan 2022-07-24 di Wayback Auto., menampilkan catatan singkat tentang protein terpilih dari PDB) • Proteopedia – Life in 3D: model 3D yang dapat dirotasi dan diperbesar dengan anotasi wiki untuk setiap struktur molekuler protein yang diketahui.

• UniProt, sumber daya universal poly peptide Situs web pendidikan dan panduan [sunting - sunting sumber ] • “Pengantar tentang Protein” dari HOPES (Huntington’s Disease Outreach Project for Education at Stanford) • Poly peptide: Biogenesi hingga Degradasi – Perpustakaan Virtual Biokimia dan Biologi Sel • Protein di britannica.com Persenyawaan Antara Polisakarida Dan Protein Yang Merupakan Source: https://id.wikipedia.org/wiki/Protein Dinding sel bakteri tersusun atas persenyawaan antara polisakarida dan protein • Jelaskan Cara Mengubah Interval Nada D Mayor • Pembagian Kerja Dan Beban Kerja Di Perusahaan Peternakan • Cara Pasang Twrp Redmi Note 7 Tanpa Pc • Berikut Ini Cara Memperkecil Resiko Resiko Usaha Adalah • Contoh Membuat Pohon Akar Masalah Tentang Peternakan • Hack Wifi Wpa2 Psk Windows 7 Cmd • Makalah Pemanfaatan Limbah Untuk Pakan Ternak • Cara Membuat Mika Lampu Mobil Dari Akrilik • Cara Melihat Nomor Hp Orang Di Messenger Kategori • Aplikasi • Berkebun • Bisnis • Budidaya • Cara • News • Pelajaran • Serba-serbi • SIM Keliling • Soal • Ternak • Uncategorized
Perhatikan gambar berikut untuk menjawab nomor 20-21 19.

Proses yang terjadi adalah . Salah satu tempat dapat ditemukannya archaebacteria adalah di rawa, saluran pencernaan, bahkan tumpukan kotoran/sampah. Mengapa habitat tersebut yang dipilih? a. Kondisi habitat memungkinkan Hidrogen (H2) direduksi oleh karbondioksida (CO2) b. Habitat tersebut mengandung banyak Oksigen (O2) c. Archaebacteria tersebut memerlukan Hidrogen (H2) sebagai sumber karbon utama d. Untuk memenuhi kebutuhan Hidrogen (H2) sebagai reduktor 23. Perhatikan gambar berikut !

20. Koloni bakteri tertentu dapat mengalami perubahan sifat akibat pengambilan materi genetik bakteri lain disekitarnya. Manakah yang benar dari pernyataan berikut a. Proses tersebut dikenal sebagai transduksi b.

Proses tersebut dilakukan dengan menggunakan pili c.

Termasuk salah satu reproduksi aseksual bakteri d. Bakteri yang tidak patogen berpeluang menjadi patogen ketika hidup disekitar bakteri patogen yang mati 21. Pasteurisasi merupakan salah satu contoh sterilisasi secara . Ditemukannya fosil utuh gajah purba (mammoth) yang masih memiliki otot dan rambut di Alpen dan Siberia, dapat memberikan kita informasi berharga, bahwa proses penguraian ternyata tergantung dengan kondisi lingkungan (suhu).

Mengapa bangkai tersebut utuh? a. Bakteri mati kedinginan ketika akan mengurai jasad b. Enzim pengurai bakteri tidak bekerja c. DNA bakteri membeku sehingga aktivitas sel berhenti d. Cahaya matahari yang dibutuhkan bakteri pembusuk tidak dapat mencapai jasad 24. Perhatikan gambar berikut ! • Company About Us Scholarships Sitemap Q&A Archive Standardized Tests Education Summit • Get Course Hero iOS Android Chrome Extension Educators Tutors • Careers Leadership Careers Campus Rep Program • Help Contact Us FAQ Feedback • Legal Copyright Policy Academic Integrity Our Honor Code Privacy Policy Terms of Use Attributions • Connect with Us College Life Facebook Twitter LinkedIn YouTube Instagram Persenyawaan antara polisakarida dan protein yang merupakan penyusun dinding sel bakteri disebut.

peptidoglikan Pembahasan: Peptidoglikan, juga dikenal sebagai murein, adalah polimer yang terdiri dari gula dan asam amino yang membentuk lapisan seperti jaring.

Peptidoglikan digunakan oleh bakeri sebagai penyusun dinding sel, yang terletak di luar membran sel. Kadar peptidoglikan dalam dinding sel ini dapat dimanfaatkan untuk klasifikasi bakteri. Bakteri Gram positif memiliki dinding sel tebal yang mengandung peptidoglikan tingkat tinggi. Sedangkan bakteri Gram negatif ditandai oleh dinding sel yang lebih tipis dengan tingkat peptidoglikan yang rendah.

Dengan diwarnai dan dilarutkan alkohol, bakteri yang dinding selnya banyak mengandung peptidoglikan akan berwarna ungu. Bakteri ini adalah bakteri jenis Gram positif. Contoh bakteri jenis Gram positif adalah Staphylococcus aureus.

Sebaliknya bakteri dengan dinding selnya mengandung sedikit peptidoglikan akan hilang pewarnya ungunya saat dilarutkan alkohol. Bakteri ini adalah bakteri jenis Gram negatif. Contoh bakteri jenis Gram negatif adalah Escherichia coli.

Antibiotik seperti Penisilin bekerja dengan mencegah pembuatan dan pembaruan dinding sel dari bahan peptidoglikan. Sehingga, Penisilin dapat membunuh dan mencegah perkembang biakan bakteri Gram positif, tapi tidak pada bakteri Gram negatif. Pelajari lebih lanjut: Bagian yang tidak dapat ditemukan pada tubuh sel monera adalah?

brainly.co.id/tugas/12274596 Kode: 10.4.5 Kelas: X Mata pelajaran: Biologi Materi: Bab 5 - Archaeobacteria dan Eubacteria (Monera) Kata kunci: Peptidoglikan
Bakteri adalah organisme prokariotik yang memiliki dinding sel yang tersusun dari peptidoglikan. Hal ini berbeda dengan tumbuhan yang dinding selnya tersusun dari selulosa, pektin, maupun lignin.

Dinding sel bakteri memiliki struktur yang agak kaku yang terletak di luar membran sel. Peranan dinding sel tersebut adalah untuk mempertahankan bentuk sel dan mencegah sel mengalami lisis.

Komponen utama dari dinding sel bakteri adlah peptidoglikan atau disebut juga dengan murein. Peptidoglikan merupakan suatu polimer yang berukuran besar yang dihubungkan dengan ikatan kovalen. Peptidoglikan terdiri dari dua macam derivat polisakarida, yakni N-acetylglucosamine dan N-acetylmuramic acid serta asam amino seperti L-alanine, D-alanine, dan D-glutamic acid.

Pada polimer peptidoglikan molekul N-acetylglucosamine bergantian dengan molekul N-acetylmuramic acid yang saling berpaut silang membentuk glycan tetrapeptide (Gambar 1). glycan tetrapeptide ini melalui tetrapeptida, empat asam amino. Sebagian besar bakteri gram positif memiliki asam amino ketiga berupa lisin sedangkan sebagian besar bakteri negatif berupa asam diaminophimelat. Rantai panjang dari peptidoglikan ini disintesis secara berdampingan untuk membentuk suatu lembaran yang melingkupi suatu sel dinding sel bakteri tersusun atas persenyawaan antara polisakarida dan protein paling atas).

Rantai-rantai peptidoglikan tersebut dihubungkan secara menyilang oleh asam amino. Sementara ikatan glikosida menghubungkan gula di dalam untaian glikan secara kovalen (Gambar 2). Pada dinding sel bakteri gram positif memiliki molekul tambahan berupa asam teikoat yang terdiri atas gliserol, fosfat, dan ribitol gula alkohol dalam bentuk polimer dengan panjang 30 unit. Polimer-polimer tersebut terkadang memanjang sampai keluar dari dinding sel dan kapsul (Gambar 3).

Pada bakteri gram positif memiliki lapisan peptidoglikan yang relatif tebal dengan ukuran 20-80 nm. Lapisan peptidoglikan tersebut menempel pada permukaan luar membran sel.

Bakteri jenis ini tidak memiliki membran luar maupun ruang periplasmik. Sehingga dengan menggunakan pewarnaan gram (Hans Christian Gram), maka bakteri ini akan nampak berwarna ungu. Adapun pada bakteri gram negatif memiliki struktur yang lebih kompleks dibandingkan dengan bakteri gram positif. Komposisi peptidoglikan sekitar 10-20% dan sisanya berupa polisakarida, protein, dan lipid. Dinding sel terdiri atas membran luar yang menyusun permukaan luar dinding dan berbatasan dengan ruang periplasmik yang sangat sempit (Gambar 4).

Pada pewarnaan gram, bakteri ini tidak bisa mempertahankan warna kristal violet pada tahap dekolorisasi. Hal ini dikarenakan dinding selnya sangat tipis dan jumlah lipoprotein serta lipopolisakarida banyak pada dinding sel.

Gambar 4. Diagram dinding sel bakteri gram negatif.
Soal: Dinding sel bakteri tersusun atas persenyawaan antara polisarida dan protein. Persenyawan tersebut dikenal dengan. *​ Jawaban dengan penjelasan: Peptidoglikan Bakteri memiliki dinding sel yang tersusun atas lapisan peptidoglikan.

Peptidoglikan adalah komponen utama dinding sel bakteri yang bersifat kaku dan bertanggungjawab untuk menjaga integritas sel serta menentukan bentuknya. Peptidoglikan merupakan polisakarida yang membentuk ikatan dengan protein #BukanmaenHalo Adik, Kakak bantu jawab ya :) Dinding sel adalah bagian sel bakteri yang berfungsi memberi bentuk dan kekuatan atau perlindungan terhadap sel.

Fungsi dinding sel adalah sebagai pelindung bagian tubuh bakteri, pemberi bentuk tubuh, dan untuk menghindari pecahnya sel ketika air dalam jumlah berlebih masuk ke sel. Dinding sel bakteri tersusun atas bahan peptidoglikan, yaitu persenyawaan antara polisakarida dan protein.

Dengan demikian, persenyawaan antara polisakarida dan protein yang merupakan penyusun dinding sel bakteri disebut peptidoglikan.

Semoga membantu!